يشكل التهاب الكبد الوبائي أحد الأمراض الأكثر انتشارا في جنوب السودان، خاصة في معسكرات النازحين واللاجئين من دول الجوار، وتُرجع منظمات إنسانية انتشار هذا النوع من المرض إلى ضعف خدمات الصحة العامة وتلوث المياه.